Федеральное государственное казённое военное образовательное учреждение высшего образования «Филиал Военного учебно-научного центра Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина» Министерства обороны Российской Федерации в г. Челябинске (далее - филиал ВУНЦ ВВС «ВВА») создан 1 июля 2013 года на основании приказа Министра обороны Российской Федерации от 30 марта 2013 года № 252 «О создании филиала федерального государственного казенного военного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина» (г. Воронеж) Министерства обороны Российской Федерации» и директивы Начальника Генерального штаба от 24 мая 2013 года № 314/10/2969.

Учредителем филиала ВУНЦ ВВC «ВВА» в г. Челябинске является Правительство Российской Федерации. Полномочия учредителя осуществляет Министерство обороны Российской Федерации.